نائب الشؤون العلمية
تتمثّل رسالة هذه النيابة في البحث وإعداد المؤلفات العلمية والأكاديمية للتعريف بالتشيّع في أبعاده المختلفة، سواء من خلال التأليف أو الترجمة، موجّهةً إلى الجمهور الدولي. ومن مهامّها الأخرى: رصد أبرز الشبهات العلمية والثقافية والاجتماعية في مجال التشيّع ونقدها، وإدارة ودعم المشاريع البحثية المنسجمة مع أهداف المؤسسة، وإتاحة الفرص الدراسية والبحثية للباحثين من خارج البلاد، إلى جانب تصميم المؤتمرات والندوات والكراسي العلمية والدورات التعليمية ذات الصلة بالدراسات الشيعية، وغير ذلك.
نائب شؤون التعاون الدولي
تتولّى نيابة التعاون الدولي مهمّة التعرّف على المؤسسات والمجامع والشخصيات العلمية والثقافية العاملة في مجال الدراسات الشيعية، والتعاون معها بهدف إقامة علاقات علمية ثنائية، وتقديم عرض دقيق ومنهجي للتشيّع للمخاطبين.
كما تشمل مهامّها متابعة الأخبار والفعاليات العلمية والثقافية والسياسية المرتبطة بالتشيّع، ورصد الندوات والمؤتمرات العلمية ذات الصلة على الساحة الدولية، والتعريف بالإنتاج العلمي والثقافي للمؤسسة ونشره بصيغتيه الورقية والإلكترونية، فضلًا عن تنظيم قنوات التواصل مع الجمهور والمخاطبين والردّ على استفساراتهم.
نائب شؤون الإعلام والفضاء الرقمي
تتمحور المسؤولية الرئيسة لهذه النيابة حول تقديم قوالب حديثة ومواكِبة لعرض المحتويات المُنتَجة، بما يتناسب مع احتياجات وتطلّعات الجمهور. وتُتابَع هذه الرسالة من خلال إنتاج وبثّ البرامج الإعلامية في مجالي التشيّع العلمي والثقافي، وكذلك إنشاء الصفحات الرسمية والمجموعات الافتراضية المتخصّصة في الدراسات الشيعية.
نائب شؤون التخطيط والدعم
تتولّى نيابة التخطيط والدعم مهمّة إعداد تخطيط شامل واستشرافي، بالتنسيق والتشاور مع سائر النيابات، بهدف الإسهام في حسن تنفيذ برامجها، إضافةً إلى تقديم الدعم المالي والتنفيذي لجميع أنشطة وبرامج النيابات المختلفة.